На американского подростка Дэна Кузо и других детей с неба посыпались волшебные карты. Дети собрали их и придумали стратегическую игру. В каждом шаре был монстр, который приобретает свои реальные рост и способности. В картах записаны способности и бонусы для монстров. Все это люди и назвали Бакуганом. Но до тех пор, пока загадочный игрок по прозвищу Маска не начал отправлять Бакуганов своих противников в измерение Смерти в Вестройе (галактика, из которой пришли Бакуганы). Дэн хорошо играл в Бакуган и понял, что это не просто игра, а нечто более важное. И Маска приобрёл нескольких лучших в мире игроков в бакуган, подчиняясь приказу бакугана Наги и человека Хелджи (дедушка Элис), которые с помощью этой игры решили захватить власть в Вестройе и на Земле.

Бакуган: Новая Вестройя

Прошло 2 года с тех пор, как Бойцы распрощались с Бакуганами. Ребята уже почти забыли про игру Бакуган, как внезапно Бакуган Дэна, Драго просит того о помощи. Вместе с Маручо Дэн отправляется в Новую Вестройю. Планету, на которой жили Бакуганы, захватили Вексы — могущественные люди с планеты Вестал. Обычный народ Вестала — весты, мирные жители. Но Вексы — это корпорация из шести бойцов-вестов, мастеров всех стихий Бакуган (как когда-то и на Дэна, на вестов тоже посыпались с неба Карты Ворот).

Имена Вексов:

Гас Грав, стихия — Сабтерра;
Волт Ластер, стихия — Хаос;
Шедоу Проув, стихия — Даркус;
Майлин Фероу, стихия — Аквос;
Линк Волан, стихия — Вентус;
Спектра Фантом, стихия — Пайрус.

Когда Дэн и Маручо попали в Новую Вестройю, они познакомились с Фронтом Сопротивления Бакуган — его предводительницей Мирой Фермен (Клэй), Эйсом и Бэроном. Вскоре к ним присоединится и Шун. Как выясняется Спектра — предводитель Вексов — брат Миры (также известный как Кит Фермен). Королевская семья — изгнанный король Вестала Зеногелд и его сын, принц Хайдрон, смещают Спектру с престола, и тот вместе со своим преданным помощником Гасом начинает мстить.

Бакуган: Вторжение Гандалианцев

Дэн, Маручо и Шун попадают в войну между двумя планетами Ниатхией и Гандалией. Гандалия использует Бакуганов и людей в войне для того чтобы покорить Ниатхию. Они объединяют свои усилия с тремя новыми бойцами: принцессой Ниатхии Фабией, другом Дэна — Джейком и гандалианом Рэном, чтобы остановить воинов Гандалии и Двенадцать приказов, а также спасти от уничтожения Ниатхию и возможно Землю.

Двенадцать приказов — это организация из шести агентов и остальных высокопоставленных людей. Агенты:

Сид Аркейл — стихия Пайрус
Мэйсон Браун — стихия Сабтерра
Зенет Сурров — стихия Хаос
Рен Краулер — главный агент, стихия Даркус
Лина Айсис — стихия Аквос
Джесси Гленн — стихия Вентус

Остальные:

Гилл — стихия Пайрус
Сабтерра Нарзак — стихия Сабтерра
Хаос Казарина — стихия Хаос
Бэродиус — стихия Даркус
Стойка — стихия Аквос
Эйзел — стихия Вентус

Цель Агентов был захват системы Бакуган Интерспейс, в то время как остальные искали Элемент. Но судьбы Агентов сложились трагически: Сид поплатился жизнью за проигрыш Элемента, а остальные за исключением Мейсона были убиты. Рен перешёл на сторону Ниатхии. Позже выяснилось, что все агенты и Нарзак живы и тоже перешли на светлую сторону. Остальные члены за исключением Бэродиуса были убиты.

Всплеск Мехтаниума

Дэн также на 1 месте среди бойцов.Но тут появляется новая команда которая по силе не уступает бойцам! Дэн пробует бой с подчинённым главы этой команды,сначала Ден привосходит противника в битве,но потом телепатической связью с ним связывается невероятно большой бакуган по имени Мехтаниум!Он вызывает в нём силу и он чуть не разорвал себя от столь сильной потери энергии.Затем драго проигрывает,и дэн решает что драго не стоит биться.Из-за этого его противники переганяют его.И у дена остаётся только одна цель найти и уничтожить Мехтаниума!